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基因测序系统

日期:2025-05-27 人气:24

基因测序系统介绍

基因测序系统通过对DNA或RNA样本进行分析以识别其序列。它的应用范围非常广泛,包括基因组学、转录组学、蛋白质组学等领域。

高通量基因测序系统的主要参数包括:

1、最大产出:可生成最高120Gb数据,一次运行可以完成10个转录组样本测序实验。

2、测序芯片适配范围:适配小于200M Reads片段标签序列的测序芯片。

3、数据读长:单端和双端读取序列均可达到150个碱基。

4、读取精度:测序质量标准为Q30,当测序长度为2x75bp时,80%以上的碱基数据质量高于Q30;当测序长度为2x150bp时,75%以上碱基数据质量高于Q30。

5、可读取的连续单个重复碱基数量:可精确读取≥12个的连续单个重复碱基(如AAAAAAAAAAAAAAAA)。

6、样品用量:DNA起始量范围为1ng-1ug。

7、自带控制计算机:仪器自带控制计算机整合到测序仪中,用于仪器控制、处理图像和碱基检出并能够实时进行分析处理。

8、仪器运行时间和数据产出:1 x 75 bp单端测序运行12小时完成;2 x 75 bp双端测序运行18小时完成;2 x 150 bp双端测序运行30小时完成。最多可在30小时内产生120G数据。

9、应用范围:可完成人类全基因组、单细胞测序、全外显子组、微生物宏基因组、肿瘤大panel等大数据量检测项目。

10、系统集成:测序系统主机内置服务器,具备样本文库克隆扩增、测序和数据分析功能,无需额外配置样本文库克隆扩增设备和服务器。

11、其他功能:支持基因测序和基因芯片扫描功能的结合,同时也是一个开放平台,可以兼容不同品牌建库试剂。

12、耗材技术:具有RFID(无线电射频识别)技术的耗材。

基因测序系统主要包括以下步骤:

1、准备样本,样本可能来自生物体的各种组织,如血液、组织、细胞等。在测序之前,必须对样本进行预处理,以提取DNA或RNA。提取后,样本需要进行质量控制和库制备。

2、将样本DNA或RNA转换为测序库。

3、测序,分为两种主要方法:Sanger测序和高通量测序。 Sanger测序是一种传统的测序技术,适用于小规模序列分析,如对单一基因的分析。高通量测序是一种高通量且成本低廉的技术,适用于大规模序列分析,如全基因组测序或转录组测序。

4、测序后,进行数据分析以识别和分析序列。

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