１．按功能分类：多元磁珠荧光酶标分析仪可分为常规型和高级型两种。常规型主要用于基本的免疫分析，包括病毒学、临床检测、环境检测等；高级型则结合了先进的光谱技术和分析算法，可实现更高精度的分析和诊断，例如肿瘤标志物检测和基因测序。
２．按结构分类：多元磁珠荧光酶标分析仪可分为台式和便携式两种。台式的仪器结构复杂，功能齐全，一般适用于实验室等专业场所；而便携式的多元磁珠荧光酶标分析仪结构简单，体积小，方便携带，适用于野外或现场快速检测。
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